《西南大学学报（自然科学版）》（ISSN1673-9868，CN 50-1189/N）是教育部主管，西南大学主办，国内外公开发行的综合性学术期刊。其前身是原《西南农业大学学报（自然科学版）》，创刊于1957年12月，2007年，经新闻出版总署批准，《西南农业大学学报（自然科学版）》更名为《西南大学学报（自然科学版）》。
本刊为月刊，公开发行，主要刊登自然科学类学术文章。现已被美国《化学文摘》、《数学评论》、英国《动物学记录》、意大利《农业索引》、中国科学引文数据库（CSCD）、中文核心期刊要目总览（北大核心）、万方数字资源系统、维普中文科技期刊全文数据库、中国数学文献数据库、《中国数学文摘》、《中国生物学文摘》、《中国无机分析化学文摘》、《中国地理科学文摘》、中国生物医学文献数据库、《俄罗斯文摘》杂志、（联合国）国际农业科技情报系统、国际农业与生物科学研究中心、美国《农业文献题库》、《中国水产文摘》等收录。
先后荣获中国高校百佳科技期刊、重庆市出版专项资金重点资助期刊、中国高校精品科技期刊、重庆市一级期刊、重庆市高校期刊研究会“学术名刊”、精品中文科技期刊、川渝一流科技期刊、重庆市高品质科技期刊等荣誉。
